Thomas fue el último prófugo de la “causa de los cuadernos”, conocida así por los cuadernos que había registrado el ex chofer de Roberto Barata, Oscar Centeno, durante el gobierno de Cristina Kirchner.
El ex director de la EBY, con sede en Posadas, permaneció prófugo durante 48 días y fue detenido gracias a la denuncia de una vecina, en un departamento de la calle Uriburu 1044, en el barrio norte de la ciudad de Buenos Aires. El Ministerio de Seguridad había ofrecido una fuerte recompensa por la información sobre su paradero.
El abogado de Thomas, José Manuel Ubeira, había afirmado en las últimas horas que el ex funcionario no se iba a entregar y presentado, en varias oportunidades, la eximición de prisión ante Bonadio.
Aseguró, además, que su cliente “no tiene nada de qué arrepentirse, porque para arrepentirse tendría que haber hecho algo malo”.
Thomas estuvo una década como director argentino de Yacyretá, el ente binacional de Argentina y Paraguay, del que se alejó en diciembre de 2015, al finalizar el mandato de Cristina Kirchner. Controló además Ebisa, organismo que tenía a cargo proyectos hidroeléctricos.
Durante su gestión se realizó el plan de terminación de Yacyretá, que abarcó principalmente las ciudades de Posadas (Misiones) y Encarnación (Paraguay), que adecuaron su zona costera por la suba de la cota de Yacyretá.